La ejecución presupuestaria del Tribunal Electoral Departamental del Beni en la gestión 2016 alcanzó el 95,39%, Según el informe de comportamiento presupuestario de ese año, de un presupuesto total de Bs.1.579.270,00 (Un Millón Quinientos Setenta y Nueve Doscientos Setenta 00/100 bolivianos). 

En la gestión 2017 se asignó al Tribunal Electoral Departamental del Beni, un presupuesto de Bs.1.889.965,00 (Un millón Ochocientos Ochenta y Nueve Novecientos Sesenta y Cinco 00/100 bolivianos), de los cuales fueron ejecutados Bs. 1.806.382,26 (Un Millón Ochocientos Seis Trecientos Ochenta y Dos 26/100 bolivianos), correspondiente a un 96% de ejecución.

En la gestión 2018 se asignó al Tribunal Electoral Departamental del Beni, un presupuesto de Bs.1.241.425,00 (Un millón Doscientos Cuarenta y Uno Cuatrocientos Veinticinco 00/100 bolivianos), de los cuales fueron ejecutados Bs. 1.191.567,63 (Un Millón Ciento Noventa y Uno Quinientos Sesenta y Siete 63/100 bolivianos), correspondiente a un 96% de ejecución.